O PEPAC, em linha com a nova PAC, estrutura-se em 2 pilares:
PILAR 1 (inteiramente financiado pela EU):
Pagamentos diretos aos agricultores mais direcionados, mais equitativos e mais ecológicos e Organização comum dos mercados (OCM) dos produtos agrícolas, garantindo um nível de vida equitativo para os agricultores e o aumento da produtividade agrícola.
PILAR 2 (cofinanciado por fundos da EU e por fundos nacionais/regionais):
Política de desenvolvimento rural, vocacionada para apoiar as zonas rurais a enfrentar os muitos desafios económicos, ambientais e societais do século XXI.
O PEPAC é de âmbito nacional, mas a sua arquitetura incorpora as especificidades das Regiões Autónomas, designadamente na componente do Desenvolvimento Rural - 2º pilar da PAC.
Adicionalmente, enquadra na sua estrutura as seguintes tipologias de intervenção:
Pilar (Fundo) | Orientada | Integrada | Especificações das regiões ultraperiféricas |
1.º Pilar (FEAGA) | Eixo A Rendimento e Sustentabilidade | Eixo B Abordagem Setorial Integrada | |
2.º Pilar (FEADER) | Eixo C Desenvolvimento Rural | Eixo D Abordagem Territorial Integrada | Eixo E Desenvolvimento Rural (RA Açores) | Eixo F Desenvolvimento Rural (RA Madeira) |